Oltre alle specie delle rupi già elencate, nelle zone umide del sito si trova Sparganium angustifolium, specie rarissima in Italia e pure rarissime nel nostro paese sono altre due specie che si trovano nel sito, il garofano glaciale Dianthus glacialis e l'elegante Viola comollia, un endemismo orobico. Una specie protetta è anche Artemisia genipi, dal caratteristico aroma.
All'interno del SIC non sono segnalate specie vegetali in allegato II della Direttiva Habitat.

Potentilla rosea (Foto di F. Gironi)

Androsace dei ghiacciai (Foto di R. Ferranti)

Primula vischiosa (Foto di R. Ferranti)

Viola di Comolli (Foto di L. Pagliarini)