Nel SIC vi sono numerose specie di invertebrati, tra cui due tra le più belle farfalle alpine, Parnassius apollo e Parnassius mnemosyne. Tra gli anfibi sono presenti la raganella, Hyla intermedia e la Rana temporaria, mentre tra i rettili figurano alcune specie interessanti come il ramarro (Lacerta bilineata), il colubro liscio (Coronella austriaca), il saettone (Zamenis longissimus) e il marasso (Vipera berus). La fauna ornitologica è molto ricca di specie, e tra le altre vi sono l'aquila reale, la coturnice, il gufo reale, il picchio nero, la civetta nana e il gallo cedrone (Tetrao urogallus) che è anche il simbolo del Parco delle Orobie Valtellinesi. Si tratta di un uccello di grosse dimensioni (il maschio può raggiungere una lunghezza di oltre 80 cm, mentre la femmina è in genere più piccola, sino a 60 cm) che vive prevalentemente nei boschi di conifere tra i 1200 e i 1700 m. La zona del SIC rappresenta una delle aree ottimali in Valtellina per ospitare questa specie, peraltro molto rara in Lombardia.
Tra i mammiferi, nel SIC si possono trovare 4 specie di pipistrelli, dal fondamentale ruolo ecologico per il controllo delle popolazioni di insetti di cui si cibano, oltre a ungulati come il cervo, il capriolo e il camoscio.

Gli uccelli sono ben rappresentati da numerose specie in All. I della Direttiva 79/409/CEE e da uccelli migratori abituali non elencati in tale direttiva.

camoscio
Rupicapra rupicapra 
Camoscio (Foto di V. Martegani)

 

capriolo
Capreolus capreolus 
Capriolo (Foto di G. Scieghi)

 

cervo
Cervus elaphus
Cervo (Foto di V. Martegani)
marasso
Vipera berus 
Marasso (Foto di E. Razzetti)
 
 
rana
Rana temporaria
Rana (Foto di C. Tognoni)
cincia dal ciuffo
Parus cristatus 
Cincia dal ciuffo (Foto di G. Scieghi)
Cincia alpestre
Parus montanus
Cincia alpestre (Foto di G. Scieghi)
 

 

Pettirosso
Erithacus rubecula 
Pettirosso (Foto di G. Bettini)
pernice bianca
Lagopus mutus helveticus 
Pernice bianca (Foto di G. Scieghi)

 

gallo cedrone
Tetrao urogallus 
Gallo cedrone (Foto di V. Martegani)

 

rampichino alpestre
Certhia familiaris 
Rampichino alpestre (Foto di G. Scieghi)