Il SIC si estende da una quota di 650 m a 2502 m e offre un bel mosaico di diverse tipologie vegetali, in cui sono presenti anche alcuni endemismi. Si possono individuare 13 habitat differenti, di cui 3 sono prioritari (6230 - nardeti ricchi di specie, 9180 - foreste di versanti, ghiaioni e valloni del Tilio-Acerion e 91E0 - foreste alluvionali di Alnus glutinosa e Fraxinus excelsior).
La quota più significativa di territorio (quasi il 70% della superficie complessiva) è caratterizzata dalla presenza di boschi, tra cui le foreste a Larix decidua (habitat 9420, 35,1% della superficie del SIC) e le foreste a Picea excelsa (habitat 9410, 20%).
Una tipologia di particolare valenza naturalistica è data dalle formazioni boschive del Tilio-Acerion (habitat prioritario 9180), una formazione a latifoglie che comprende aceri, tigli, frassini, ciliegi, olmi e faggi e che si trova nelle forre, in ambienti più umidi di quelli di faggeta e che copre un'area abbastanza rilevante di territorio (11,1%).
Le foreste alluvionali di Alnus glutinosa e Fraxinus excelsior (habitat prioritario 91E0) sono strettamente collegate a corsi d'acqua o alle rive di lago, e nel SIC si trovano sul versante ovest  della valle del torrente Torchione.
Anche le praterie montane da fieno (habitat 6520) ricoprono un'estensione apprezzabile (8% della superficie complessiva). Si tratta di ambienti seminaturali, perché occupano aree disboscate dall'uomo e richiedono pratiche colturali regolari, come lo sfalcio, che deve essere effettuato almeno due volte l'anno, e la concimazione. Le praterie da fieno rappresentano uno dei connotati più tipici del paesaggio montano, e una fonte essenziale di foraggio per il bestiame domestico. Questi habitat sono ancora ben rappresentati nel SIC, in particolare nel settore settentrionale in corrispondenza di numerosi insediamenti rurali di media quota (maggenghi).
I nardeti ricchi di specie (habitat prioritario 6230) sono prati soggetti a pascolo intenso e prolungato nel tempo, soprattutto su terreni a pendenza ridotta. La specie caratteristica e dominante è Nardus stricta, una graminacea cespitosa poco appetita dal bestiame. L'estensione attuale di questo habitat nel sito è relativamente ridotta (meno del 5% della superficie complessiva), con una distribuzione preferenziale nella zona del Lago della Casera - Lago delle Zocche.
Nella parte più alta del SIC, sul versante nord del Pizzo Campaggio, vi è una zona di torbiera (habitat 7140) che, nonostante la ridotta superficie, presenta un motivo di particolare interesse, in quanto questi ambienti sono dei “relitti” dell'epoca glaciale e ospitano specie rare di notevole importanza floristica. Anche gli habitat delle acque stagnanti (3130) sono di grande interesse perché consentono la vita a comunità animali e vegetali ricche e diversificate; nel sito ci sono due piccole aree in corrispondenza del Lago delle Zocche e del Lago della Casera, nelle quali si trovano anche popolamenti di Sparganium angustifolium.

Fisionomia Codice Habitat % copertura
Acque stagnanti 3130 Acque stagnanti, da oligotrofe a mesotrofe, con vegetazione dei Littorelletea uniflorae e/o degli Isoeto-Nanijuncetea 0,04
Arbusteti 4060 Lande alpine e boreali 4,8
Formazioni erbacee naturali e seminaturali 6150 Formazioni erbose boreo-alpine silicicole 0,3
6230 * Formazioni erbose a Nardus, ricche di specie, su substrato siliceo delle zone montane ( e delle zone submontane dell'Europa continentale) 4,8
6432 Comunità erbacee subalpine e alpine 2,8
6520 Praterie montane da fieno 8,2
Torbiere 7140 Torbiere di transizione e instabili 0,02
Rocce e pietraie 8110 Ghiaioni silicei dei piani montano fino a nivale (Androsacetalia alpinae e Galeopsietalia ladani) 0,4
8220 Pareti rocciose silicee con vegetazione casmofitica 0,5
Foreste 91E0 Boschi alluvionali di Alnus glutinosa e Fraxinus excelsior (Alno-Padion, Alnion incanae e Salicion albae) 1,3
9180 Boschi di pendio, detrito o forra del Tilio-Acerion 11,1
9260 Boschi di Castanea sativa 9,9
9410 Boschi acidofili montani e alpini di Picea (Vaccinio-Picetea) 20,1
9420 Boschi alpini a Larice e Cembro 35,1
TOTALE 99,72