Nel SIC vi sono numerose specie di invertebrati, tra cui due tra le più belle farfalle alpine, Parnassius apollo e Parnassius mnemosyne. Tra gli anfibi sono presenti la raganella, Hyla intermedia e la Rana temporaria, mentre tra i rettili figurano alcune specie interessanti come il ramarro (Lacerta bilineata), il colubro liscio (Coronella austriaca), il saettone (Zamenis longissimus) e il marasso (Vipera berus). La fauna ornitologica è molto ricca di specie, e tra le altre vi sono l'aquila reale, la coturnice, il gufo reale, il picchio nero, la civetta nana e il gallo cedrone (Tetrao urogallus) che è anche il simbolo del Parco delle Orobie Valtellinesi. Si tratta di un uccello di grosse dimensioni (il maschio può raggiungere una lunghezza di oltre 80 cm, mentre la femmina è in genere più piccola, sino a 60 cm) che vive prevalentemente nei boschi di conifere tra i 1200 e i 1700 m. La zona del SIC rappresenta una delle aree ottimali in Valtellina per ospitare questa specie, peraltro molto rara in Lombardia.
Tra i mammiferi, nel SIC si possono trovare 4 specie di pipistrelli, dal fondamentale ruolo ecologico per il controllo delle popolazioni di insetti di cui si cibano, oltre a ungulati come il cervo, il capriolo e il camoscio.
Gli uccelli sono ben rappresentati da numerose specie in All. I della Direttiva 79/409/CEE e da uccelli migratori abituali non elencati in tale direttiva.
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Camoscio (Foto di V. Martegani)
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Capriolo (Foto di G. Scieghi)
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Stambecco (Foto di G. Bettini)
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Marmotta (Foto di G. Scieghi)
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Lepre bianca (Foto di G. Scieghi)
![Picchio nero](/sites/default/files/inline-images/10parco_picchionero_scieghi.jpg)
Picchio nero (Foto di G. Scieghi)
![ramarro](/sites/default/files/inline-images/Lacerta_bilineata__ValMadre_Tognoni.jpg)
Ramarro (Foto di C. Tognoni)
![picchio rosso](/sites/default/files/inline-images/picchio%20rosso.jpg)
Picchio rosso maggiore (Foto di G. Bettini)