Le specie di piante che arricchiscono la biodiversità del sito sono numerose. Negli ambienti di rupi silicee si possono vedere fiori di grande bellezza, come l'Androsace brevis o l' Androsace vandellii, piante endemiche con areale ristretto e localizzate sulle pendici del Legnone. Sempre sulle pendici del Legnone si possono incontrare diverse sassifraghe, come per esempio Saxifraga exarata o Saxifraga bryoides. Il nome “sassifraga” deriva dal latino e significa “che rompe i sassi”: molte specie di questo genere infatti vivono nelle fenditure delle rocce.

Androsace orobia
Androsace brevis (Hegtschw.) Ces. 
Androsace orobia (Foto di R. Ferranti)
Androsace di Vandelli
Androsace vandellii (Turra) Chiov. 
Androsace di Vandelli (Foto di R. Ferranti)
Colombina gialla
Corydalis lutea (L.) DC 
Colombina gialla (Foto di R. Ferranti)
Carice ricurva
Carex curvula (All.)
Carice ricurva (Foto di R. Ferranti)
Doronico del granito
Doronicum clusii (All.) Tausch 
Doronico del granito (Foto di R. Ferranti)a
Eritrichio nano
Eritrichium nanum (All.) Schrader
Eritrichio nano (Foto di R. Ferranti)
Sassifraga solcata
Saxifraga exarata Vill.
Sassifraga solcata (Foto di R. Ferranti)
Primula integrifolia
Primula integrifolia L.
Primula a foglie intere (Foto di R. Ferranti)
Arnica
Arnica montana L. 
Arnica (Foto di R. Ferranti)
Digitale gialla maggiore
Digitalis grandiflora Mill. 
Digitale gialla maggiore (Foto di R. Ferranti)
Genziana punteggiata
Gentiana punctata L.
Genziana punteggiata (Foto di R. Ferranti)
Genziana porporina
Gentiana purpurea L.
Genziana porporina (Foto di R. Ferranti)
Potentilla rosea
Potentilla nitida L.
Potentilla rosea (Foto di R. Ferranti)