In questo SIC si trova un invertebrato ormai molto raro nella nostra regione: il gambero di fiume (Austropotamobius pallipes). Questo crostaceo è molto sensibile all'inquinamento e al disturbo umano.
Tra i pesci vi sono il vairone (Leuciscus souffia muticellus), inserito in Allegato II della Direttiva Habitat, e il temolo (Thymallus thymallus), inserito in Allegato V, che rappresenta uno degli elementi di maggiore pregio dell'ittiofauna del SIC.
Le specie di uccelli presenti sono numerose; vi sono il picchio nero, la pernice bianca, il francolino di monte, il fagiano di monte e la coturnice ed anche il martin pescatore (Alcedo atthis) e il gufo reale (Bubo bubo).
Per i mammiferi sono segnalate sei specie di pipistrelli, e tra gli ungulati vi sono caprioli e camosci. I cervi sono presenti, ma con bassa densità e gli stambecchi fanno la loro comparsa solo occasionalmente quando sconfinano dalle Orobie bergamasche.
Il sito ospita numerose specie in All. I della Direttiva 79/409/CEE. compaiono anche e uccelli migratori abituali non elencati in tale direttiva. Due specie di mammiferi, tre di pesci e il gambero di fiume (Austropotamobius pallipes) figurano nell'All. II della Dir. 92/43/CEE.