Il SIC ospita alcune specie rarissime nella flora valtellinese come Asperula purpurea, che si trova su pendici calde e assolate poco sotto al limite inferiore del SIC, Corydalis cava nei boschi di faggio poco sotto al limite inferiore del SIC, Daphne laureola nei boschi caldi al limite inferiore del SIC, l'orchidea Orchis sambucina e la bellissima Tulipa australis su prati magri e ben esposti. Il vischio (Viscum album) è raro e si trova sul pino silvestre nella parte ovest del SIC. Nel SIC è segnalato Laserpitium krapfii, una specie endemica che vegeta sui ghiaioni.