Oltre alle specie delle rupi già elencate, nelle zone umide del sito si trova Sparganium angustifolium, specie rarissima in Italia e pure rarissime nel nostro paese sono altre due specie che si trovano nel sito, il garofano glaciale Dianthus glacialis e l'elegante Viola comollia, un endemismo orobico. Una specie protetta è anche Artemisia genipi, dal caratteristico aroma.

All'interno del SIC non sono segnalate specie vegetali in allegato II della Direttiva Habitat.